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La lutte contre les adventices à l’aide du biocontrôle peut être réalisé par différents moyens : 

* au niveau de l’habitat, profitant naturellement des prédateurs de graines de mauvaises herbes ou des bactéries

* par l’utilisation de moyens biologiques : mycoherbicides et auxiliaires 

* par allélopathie et substances naturelles

Les moyens de lutte biologique contre les adventices sont peu avancés et les études de l’effet des auxiliaires du sol en tant que consommateur de graines sont encore à leur début. Néanmoins, on s’intéresse de plus en plus, à l’intérêt de préserver une faune ayant un régime alimentaire totalement ou partiellement granivore. Ces auxiliaires, comme les insectes de la famille des carabidés, pourraient contribuer à limiter le stock semencier des adventices et ainsi être une méthode préventive. 

Il existe aussi certaines rhizobactéries qui ont la capacité de réduire ou inhiber la croissance des adventices par la sécrétion de toxines.

Les mycoherbicides sont des préparations à base de champignons (spores, mycélium,…) provoquant une maladie spécifique qui permet de lutter contre les mauvaises herbes avec un spectre d’action souvent limité voire spécifique. Elles s’appliquent au champ sous la forme de suspensions pulvérisées. 
Pour lutter contre les adventices des cultures ou les plantes envahissantes, certains organismes auxiliaires phytophages peuvent être utilisés. Bien qu’elle permette la diminution du recours aux herbicides par les collectivités ainsi que la lutte contre les espèces végétales envahissantes dans les zones difficiles d’accès, cette méthode est peu adaptée pour le désherbage en agriculture qui exige de la réactivité. 
L’utilisation de mycoherbicides et d’auxiliaires est restée limitée à certains pays du fait d’un manque d’efficacité de ces outils mais aussi de la spécificité de la lutte qui vise essentiellement une espèce et qui donc ne gère pas les compositions floristiques diverses fréquentes dans nos contrées.

Certaines plantes à propriétés allélopathiques peuvent être utilisées comme des bio-herbicides contre certaines adventices tout comme des substances naturelles comme de la farine de gluten de maïs par exemple. 

L'acide nonanoïque (C₉H₁₈O₂), obtenu par extraction végétale, destructure la cuticule entraînant la perméabilisation des cellules. Ceci engendre une déshydratation quasi immédiate des tissus, avec effet visible dans les 2 heures qui suivent l'application.

Ces produits sont utilisables pour le désherbage de la vigne, l'épamprage de la vigne et le défanage de la pomme de terre.