L'objectif du congrès 2016 était de faire le point sur les connaissances acquises par la communauté scientifique française dans tous les domaines s'intéressant aux pesticides.

Prenant appui sur un constat national de la contamination généralisée de tous les milieux par ces composés dont notamment le milieu aquatique, le colloque visait à alimenter une réflexion nationale sur ce sujet critique en phase avec le plan Ecophyto 2 lancé en 2015.