Les micro-organismes (champignons, bactéries, levures…) constituent aujourd'hui des pistes techniques alternatives efficaces et particulièrement intéressantes. Certaines espèces (Gliocladium catenulatum, Bacillus subtilis…) sont des ennemis naturels de nombreux champignons pathogènes (Botrytis cinerea, Fulvia fulva…). Compétition (spatiale, nutritive), colonisation, hyper parasitisme : les mécanismes mis en place sont variables en fonction des circonstances et des situations rencontrées.

Les producteurs de tomate en production conventionnelle hors sol ont de plus en plus recours à ce type d’approche :

- Utilisation de micro-organismes aux pouvoirs et modes d’action variables selon les cibles ;

- Niveau de rupture par substitution et/ou re-conception du SDC selon la stratégie visée ;

- Baisse importante de l’IFT chimique de l’exploitation.

Plusieurs itinéraires techniques ont été mis en place au sein du groupe DEPHY Tomate hors-sol Prince de Bretagne.