Prototypage d’un outil de diagnostic moléculaire démocratisable pour une gestion durable des adventices

Appel à projet MAA - CASDAR Recherche Technologique - 2016

L’objectif du projet est de mettre à disposition les moyens de diagnostic moléculaire pour une gestion améliorée de la santé des cultures, en s’inspirant des approches connaissant un fort développement dans le domaine de la santé humaine, qui voit l’émergence d’outils de diagnostic in situ, conçus de manière ouverte dans des approches « Do It Yourself » (DIY), aussi appelées « biologie de garage » (Biohacking).

Nous prenons le parti dans ce projet de réaliser une démarche de prototypage d’un diagnostic moléculaire à bas coût, pouvant être mis en œuvre dans le contexte agricole, en choisissant comme cas d’étude un enjeu agricole majeur en grandes cultures : la gestion des adventices résistantes aux traitements herbicides. Notre parti pris est que l’ampleur du phénomène reste sous-évaluée et que les modifications parfois drastiques de pratiques (rotation par exemple) qui peuvent être nécessaires seront facilitées en apportant aux producteurs un diagnostic personnalisé de leur situation. En prenant le cas précis des ivraies résistantes aux sulfonylurées, notre projet aura pour objectif de :

• Prototyper et valider un outil de diagnostic moléculaire pouvant être construit et mis en œuvre de manière autonome par des techniciens agricoles et agriculteurs
• Créer une dynamique de partage des problématiques agricoles entre le monde du Biohacking et le monde agricole
• Valider des protocoles existants de diagnostic de la résistance (liée à la cible) sur le système prototype
• Améliorer et valider des protocoles de laboratoire pouvant apporter une plus-value par rapport aux protocoles existants (résistance non liée à la cible, Next Generation Sequencing, NGS).

Thèmes abordés : diagnostic moléculaire, Do-It-Yourself, Ivraie, résistance aux herbicides

Organisme chef de file : ARVALIS Institut du Végétal

Partenaires : ADNid, La Paillasse, SupBiotech, UMR Agroécologie

Montant prévisionnel financé : 95 345€